Élucider la résistance et la susceptibilité à la paratuberculose
Complété
APERÇU DU PROJET
Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis (MAP) est à l’origine de la paratuberculose, une maladie responsable de pertes économiques considérables dans l’industrie laitière. Cette recherche portait sur les variations génétiques et épigénétiques chez l’hôte associées à la susceptibilité et à la tolérance à la paratuberculose. Les chercheurs ont également examiné la diversité génétique des souches de MAP et la dynamique hôte-pathogène responsable de la progression de la maladie chez les vaches infectées par MAP.
Qu’a fait l’équipe de recherche?
L’équipe a recueilli des échantillons de 3 300 vaches dans 22 troupeaux laitiers en Ontario et au Québec et identifié des modèles de transmission entre troupeaux au moyen du séquençage du génome entier, un outil épidémiologique utilisé pour valider que les mouvements des vaches étaient la cause de la transmission de la maladie entre les troupeaux.
Des échantillons ont été prélevés chez 67 vaches de ces 22 troupeaux afin d’étudier la variabilité des souches de MAP.
Dans 4 troupeaux laitiers, 14 vaches excrétant MAP ont été étudiées plus en détail afin de déterminer si plusieurs souches de MAP infectaient un animal infecté et si une microévolution de MAP avait lieu.
De plus, ce projet a permis de développer un test PCR multiplex pour la paratuberculose plus sensible que les kits commerciaux actuellement disponibles.
Qu’a découvert l’équipe de recherche?
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Identification de marqueurs génétiques associés à la susceptibilité de développer la paratuberculose.
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Variations épigénétiques associées à la susceptibilité à la paratuberculose.
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Les vaches peuvent être infectées par plusieurs souches de MAP, et la souche de MAP peut évoluer dans la vache.
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Les souches de MAP diffèrent considérablement d’une ferme à l’autre. Cette variabilité pourrait expliquer les différences de gravité de la paratuberculose présente dans les fermes.
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Cette information peut être utilisée pour expliquer les différences observées entre la propagation de MAP et les signes cliniques associés à une infection par MAP, tels qu’une diarrhée de longue durée, une perte de poids progressive, une diminution de la production de lait, et une augmentation de la mise à la réforme et de la mortalité.
- L’efficacité d’une nouvelle technologie de réaction en chaîne par polymérase quantitative utilisée pour détecter l’infection par MAP a été évaluée.
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Chercheurs principaux
Nathalie Bissonnette
Agriculture et Agroalimentaire Canada (Sherbrooke)
Kapil Tahlan
Université Memorial de Terre-Neuve
Co-chercheurs
David Kelton
Université de Guelph
Flavio Schenkel
Université de Guelph
Eveline Ibeagha-Awemu
AAC (Sherbrooke)
Gilles Fecteau
Université de Montréal
Franck Biet
Institut national de la recherche agronomique (France)
Mots clés
- Paratuberculose, microévolution, épidémiologie génomique, variation épigénétique
Période: 2019-2023
Budget: 1 019 988 $
Dernière mise à jour : 11 janvier 2024
Remarque : Conformément à l’entente de recherche, outre l’offre de soutien financier, les bailleurs de fonds PLC n’ont aucun rôle décisionnel dans la réalisation des études, la collecte et l’analyse ou l’interprétation des données. Les chercheurs sont indépendants dans la conduite de leurs études, ils demeurent propriétaires de leurs données et rapportent leurs conclusions, quels que soient les résultats obtenus. La décision de publier les résultats appartient entièrement aux chercheurs.
RESSOURCES DE COMMUNICATION ISSUES DU PROJET
INFOGRAPHIE
TÉLÉCHARGERPUBLICATIONS DU PROJET
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Bissonnette, N., J.-P. Brousseau, S. Ollier, A.S. Byrne, E.M. Ibeagha-Awemu, K. Tahlan. 2024. Systematic assessment of the reliability of quantitative PCR assays targeting IS900 for the detection of Mycobacterium avium ssp. paratuberculosis presence in animal and environmental samples. J. Dairy Sci. https://doi.org/10.3168/jds.2023-24566
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Byrne, A., S. Ollier, K. Tahlan, F. Biet, N. Bissonnette. 2023. Genomic epidemiology of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis isolates from Canadian dairy herds provides evidence for multiple infection events. Front. Genet. 14: 1043598. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9934062/
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Byrne, A., N. Bissonnette, S. Ollier, K. Tahlan. 2023. Investigating in vivo Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis microevolution and mixed strain infections. Microbiol. Spectr. 11(5): e01716-23. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/37584606
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Marete, A., O. Ariel, E. Ibeagha-Awemu, N. Bissonnette. 2021. Identification of Long Non-coding RNA Isolated From Naturally Infected Macrophages and Associated With Bovine Johne's Disease in Canadian Holstein Using a Combination of Neural Networks and Logistic Regression. Front. Vet. Sci. 8: 639053. https://doi.org/10.3389/fvets.2021.63905
- Ibeagha-Awemu, E.M., N. Bissonnette, S. Bhattarai, M. Wang, P.-L. Dudemaine, S. McKay, X. Zhao. 2021. Whole Genome Methylation Analysis Reveals Role of DNA Methylation in Cow's Ileal and Ileal Lymph Node Responses to Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis Infection. Front. Genet. 12: 797490. https://doi.org/10.3389/fgene.2021.797490